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| 文學院 |
中國文學系暨研究所 |
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| 外國語文學系暨研究所 |
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| 歷史學系暨研究所 |
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| 哲學系暨研究所 |
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| 人類學系暨研究所 |
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| 圖書資訊學系暨研究所 |
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| 日本語文學系暨研究所 |
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| 戲劇學系暨研究所 |
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| 藝術史研究所 |
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| 語言學研究所 |
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| 音樂學研究所 |
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| 臺灣文學研究所 |
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| 華語教學碩士學位學程 |
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| 翻譯碩士學位學程 |
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| 工學院 |
土木工程學系暨研究所 |
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| 機械工程學系暨研究所 |
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| 化學工程學系暨研究所 |
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| 工程科學及海洋工程學系暨研究所 |
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| 材料科學與工程學系暨研究所 |
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| 環境工程學研究所 |
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| 應用力學研究所 |
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| 建築與城鄉研究所 |
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| 高分子科學與工程學研究所 |
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| 工業工程學研究所 |
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| 醫學工程學研究所 |
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| 醫學院 |
醫學系 |
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| 藥學系暨研究所 |
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| 護理學系暨研究所 |
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| 醫學檢驗暨生物技術學系暨研究所 |
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| 職能治療學系暨研究所 |
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| 物理治療學系暨研究所 |
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| 臨床醫學研究所 |
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| 臨床藥學研究所 |
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| 毒理學研究所 |
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| 分子醫學研究所 |
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| 免疫學研究所 |
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| 醫學工程學研究所 |
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| 解剖學暨細胞生物學研究所 |
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| 生物化學暨分子生物學研究所 |
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| 生理學研究所 |
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| 微生物學研究所 |
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| 藥理學研究所 |
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| 病理學研究所 |
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| 法醫學研究所 |
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| 腫瘤醫學研究所 |
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| 臨床基因醫學研究所（基因體暨蛋白體醫學研究所） |
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| 腦與心智科學研究所 |
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| 理學院 |
數學系暨研究所 |
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| 物理學系暨研究所 |
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| 化學系暨研究所 |
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| 地質學系暨研究所 |
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| 心理學系暨研究所 |
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| 地理環境資源學系暨研究所 |
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| 大氣科學系暨研究所 |
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| 海洋研究所 |
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| 天文物理研究所 |
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| 應用物理研究所 |
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| 電機資訊學院 |
電機工程學系暨研究所 |
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| 資訊工程學系暨研究所 |
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| 資訊網路與多媒體研究所 |
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| 光電工程學研究所 |
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| 電信工程學研究所 |
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| 電子工程學研究所 |
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| 生醫電子與資訊學研究所 |
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| 公衛學院 |
公共衛生學系 |
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| 健康政策與管理研究所 |
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| 職業醫學與工業衛生研究所 |
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| 流行病學與預防醫學研究所 |
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| 環境衛生研究所 |
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| 公共衛生碩士學位學程 |
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| 牙醫專業學院 |
牙醫學系 |
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| 臨床牙醫學研究所 |
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| 口腔生物科學研究所 |
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| 社會科學院 |
政治學系暨研究所 |
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| 經濟學系暨研究所 |
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| 社會學系暨研究所 |
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| 國家發展研究所 |
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| 新聞研究所 |
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| 社會工作學系暨研究所 |
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| 生命科學院 |
生命科學系 |
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| 生化科技學系暨研究所 |
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| 動物學研究所 |
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| 植物科學研究所 |
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| 分子與細胞生物學研究所 |
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| 生態學與演化生物學研究所 |
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| 漁業科學研究所 |
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| 生化科學研究所 |
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| 基因體與系統生物學學位學程 |
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| 生物資源暨農學院 |
農藝學系暨研究所 |
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| 生物環境系統工程學系暨研究所 |
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| 農業化學系暨研究所 |
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| 植物病理與微生物學系暨研究所 |
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| 森林環境暨資源學系暨研究所 |
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| 動物科學技術學系暨研究所 |
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| 農業經濟學系暨研究所 |
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| 園藝暨景觀學系暨研究所 |
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| 生物產業傳播暨發展學系暨研究所 |
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| 生物產業機電工程學系暨研究所 |
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| 昆蟲學系暨研究所 |
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| 食品科技研究所 |
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| 生物科技研究所 |
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| 植物醫學碩士學位學程 |
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| 法律學院 |
法律學院 |
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| 科際整合法律學研究所 |
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| 獸醫專業學院 |
獸醫學系暨研究所 |
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| 臨床動物醫學研究所 |
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| 分子暨比較病理生物學研究所 |
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